Sağlık Eğitimleri
VI. Temel Klinik Proteomik Uygulamaları Kursu
KONTENJANIMIZ DOLMUŞTUR!!!!
VI. Temel Klinik Proteomik Uygulamaları Kursu
TARİH : 23-25 Mayıs 2022
YER : KOU Yeni Araştırma Binası Proteomik Laboratuarı
KURS BAŞKANI : Prof. Dr. Murat KASAP
KURS DÜZENLEME KURULU
Prof.. Dr. Murat Kasap (Kurs Başkanı)
Doç.Dr. Gürler Akpınar
EĞİTMENLER
Prof. Dr. Murat Kasap
Doç.Dr. Gürler Akpınar
Dr. Öğr. Üye. Aylin Kanlı
Arş. Gör. Mehmet Sarıhan
İletişim:
Kurs Sekreteri:
Doç. Dr.Gürler Akpınar
(gurlerak@kocaeli.edu.tr),
05337424857
Proteomiks Laboratuarı (0 262 303 4900)
AMAÇ: Katılımcılara temel proteomiks yaklaşımlar hakkında teorik ve pratik bilgi ve deneyim kazandırmak.
KURS KATILIMCI SAYISI : Maksimum 15 KİŞİ
Ek-2 KURS YERİ : KOCAELİ ÜNİVERSİTESİ UMUTTEPE YERLEŞKESİ, YENİ ARAŞTIRMA BİNASI, PROTEOMİK LAB. KAT2, İZMİT/KOCAELİ
KURS ÜCRETİ :
KURS İÇERİĞİ :
Bu kursun amacı özellikle son yıllarda içerisinde büyük bir yükseliş gösteren ve ülkemizde de önemi artan proteomik araştırmaları konusunda ilgi duyan araştırmacılara bilgi sunmaktır. Kursumuz içerik olarak iki kısımdan oluşmaktadır; Birinci kısım teorik bilgi ikinci kısım ise verilen teorik bilginin uygulamaya konulmasıdır. Katılımcılara değişik biyolojik kaynaklardan protein örneklerinin hazırlanması, bu örneklerin protein konsantrasyonlarının ölçülmesi, içeriklerinin fraksiyonlanması, western blotlama, iki boyutlu jel elektroforezine tabi tutulması, jeller üzerindeki spotların boyanarak görüntülenmesi, analizi, kesimi ve MALDI-TOF-TOF ve LC-MS/MS mass spektrometrelerine hazırlanması ve analizleri hem teorik olarak anlatılacak hem de pratikleri yaptırılacaktır.
SEM HESAP NO :
Kocaeli Üniv. Döner Sermaye-SEM Kocaeli Üniversitesi/Kocaeli Şubesi
Hesap No: 2726-13221619- 5342 IBAN TR4000 0100 2726 1322 1619 5342 (Ad-Soyad ve kurs adı bilgilerinin dekontlarda belirtilmelidir)
SERTİFİKASYON : Kocaeli Üniversitesi Sürekli Eğitim Merkezi tarafından KATILIM BELGESİ verilecektir
ÖN KOŞUL : İlgi duyan tüm araştırmacı ve öğrencilerin başvurusuna açıktır.
SON BAŞVURU TARİHİ : 10 Mayıs 2022
BAŞVURU : Kurs sekreteri ile irtibata geçilerek kontenjan durumuna göre kayıt yaptırılmasının ardından kurs ücretinin yatırıldığını gösteren banka dekontunun gurlerak@kocaeli.edu.tr adresine gönderilmesiyle katılım sağlanacaktır.
Bankaya ücret yatırmadan önce kontenjan durumunu telefon ile ya da e-posta ile sorgulayınız.
Kursiyerlerin laboratuvara uygun forma/kıyafet/önlük getirmeleri önerilir.
İLETİŞİM : Doç. Dr. Gürler AKPINAR
Kocaeli Üniversitesi, Umuttepe Yerleşkesi, Yeni Araştırma Binası, Proteomiks Laboratuarı, Kat.2, İzmit/Kocaeli Tlf: 0-262-303 4900 gurlerak@kocaeli.edu.tr http://proteomik.kocaeli.edu.tr/
KURS PROGRAMI
1. Gün (23.Mayıs.2022)
Teorik Ders 1
(9:00-9:45) Biyolojik materyallerden protein izolasyon teknikleri ve protein özütlerinin hazırlanması. Protein konsantrasyon ölçüm metotları Dr.Murat Kasap
Lab pratiği 1
(10:00-10:45) İnsan hücre kültüründen ve dokudan protein özütlerinin hazırlanması. Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar, Dr.Aylin Kanlı
Lab pratiği 2
(11:00-12:00) Bradford ve BCA assay ölçümleri için hazırlanan protein özütlerinde protein konsantrasyon tayini. Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar, Dr.Aylin Kanlı
Teorik Ders 2
(13:00-13:45) SDS-PAGE ve western blotlama Dr. Aylin Kanlı
Lab pratiği 3
(14:00-17:30) SDS-PAGE jellerinin dökümü, protein örneklerinin hazırlanması ve örneklerin membrana transferi. Dr.Aylin Kanlı, Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar,
Lab pratiği 4
(17:30-17:45) IPG striplerin bir sonraki güne hazırlanması (Rehidrasyonu) Dr.Gürler Akpınar, Dr.Murat Kasap, Dr.Aylin Kanlı
2. Gün (24.Mayıs.2022)
Teorik Ders 1
(09:00-9:45) İzoelektrik fokuslama ve PAGE (Proteinlerin 1. ve 2. boyutta ayrımı) Dr. Gürler Akpınar
Lab pratiği 1
(10:00-10:30) Striplerin fokuslanmaya konulması Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar, Dr.Aylin Kanlı
Teorik Ders 2
(10:30-11:15) Biyolojik sıvılardan (serum, idrar, BOS ve perikard) protein örneklerinin hazırlanması Dr. Murat Kasap
Lab Pratiği 2
(11:20-12:00) Ultrafiltrasyon ile idrar konsantrasyonu ve tampon değişimi Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar, Dr.Aylin Kanlı
Lab pratiği 3
(16:00-17:30) Striplerin SDS-PAGE için hazırlanması, SDS-PAGE’de yürütülmesi ve boyama Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar, Dr.Aylin Kanlı
Teorik Ders II
(17:30-18:15) LC-MS/MS ile protein tanımlama ve label-free kantitasyon Y. Biy. Mehmet Sarıhan
3. Gün (25.Mayıs.2022)
Lab pratiği 1
(9:00-10:45) Görüntüleme teknikleri, spot analizlerinin yapılması ve protein spotlarının robotik metodla kesimi Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar, Dr.Aylin Kanlı
Teorik Ders 1
(10:45-11:20) MALDI TOF/TOF analizi ve protein tanımlama Dr.Gürler Akpınar,
Lab pratiği 2
(11:20-12:00) Örneklerin MALDI-TOF/TOF için hazırlanması Zip Tip ile örnek temizlenmesi ve MALDI-Platelere yerleştirilmesi, MALDI okumalarının yapılması ve proteinlerin tanımlanması Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar, Dr.Aylin Kanlı
Lab pratiği 3
(13:00-14:00) Örneklerin LC-MS/MS için hazırlanması, okumalarının yapılması ve proteinlerin tanımlanması Dr.Murat Kasap, Dr. Gürler Akpınar, Y. Biy. Mehmet Sarıhan
Lab pratiği 4
(14:00-17:30) LC-MS/MS ile proteinlerin tanımlanması (Database Search) Dr.Murat Kasap, Dr.Gürler Akpınar, Y. Biy. Mehmet Sarıhan
Belgelerin verilmesi